Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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