Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trav4-2A0A075B638 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trav4-2A0A075B638 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trav4-2A0A075B638 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trav4-2A0A075B638 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trav4-2A0A075B638 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trav4-2A0A075B638 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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