Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv31A0A075B5J5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms