Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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Limd1Q9QXD8 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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