Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Rabgef1Q9JM13 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Rabgef1Q9JM13 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Rabgef1Q9JM13 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Rabgef1Q9JM13 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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