Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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