Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms