Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms