Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms