Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Siah1bQ06985 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms