Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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