Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprkP35822 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprkP35822 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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