Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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Hoxd9P28357 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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