Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpraP18052 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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