Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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Ccl20O89093 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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Ccl20O89093 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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