Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rnft1Q9DCN7 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnft1Q9DCN7 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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