Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms