Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CtifQ6PEE2 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms