Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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NipblQ6KCD5 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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