Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms