Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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