Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ptchd1Q14B62 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms