Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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