Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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