Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms