Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms