Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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