Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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