Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Msrb1Q9JLC3 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms