Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms