Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Csmd1Q923L3 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms