Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Cldn34c1Q8K193 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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Cldn34c1Q8K193 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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Cldn34c1Q8K193 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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Cldn34c1Q8K193 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Cldn34c1Q8K193 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms