Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NipblQ6KCD5 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms