Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28047Q3US59 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms