Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Trim71Q1PSW8 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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