Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Traf3ip1Q149C2 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms