Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms