Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PtpreP49446 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PtpreP49446 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PtpreP49446 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PtpreP49446 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpreP49446 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpreP49446 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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