Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb4P10284 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxb4P10284 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms