Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Ccl20O89093 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccl20O89093 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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