Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Usp9yF8VPU6 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms