Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hdac6Q9Z2V5 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms