Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sh3bp5Q9Z131 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms