Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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