Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trpc5Q9QX29 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms