Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PtprtQ99M80 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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