Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Atg4aQ8C9S8 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Atg4aQ8C9S8 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Atg4aQ8C9S8 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Atg4aQ8C9S8 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Atg4aQ8C9S8 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Atg4aQ8C9S8 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Atg4aQ8C9S8 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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