Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp38Q8BW70 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms