Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc18Q640L5 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc18Q640L5 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms