Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp39Q3TIX9 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms